<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal title</title>
<title_fa>عنوان نشریه</title_fa>
<short_title>Quarterly Journal of Science  Kharazmi University</short_title>
<subject>Literature &amp; Humanities</subject>
<web_url>http://jsci.khu.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn></journal_id_issn>
<journal_id_issn_online></journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>doi</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1356</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>1977</year>
	<month>8</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>1356</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی نظری مکانیزم کاتالیستی و مهار آنتی بیوتیک های بتالاکتام به وسیلۀ متالوبتالاکتامازها در حلال ها و دماهای مختلف با استفاده از محاسبات مکانیک کوانتومی</title_fa>
	<title>Theoritical study on the catalytic and inhibition mechanism of the β-lactam antibiotics by metallo-β-lactamases in the different solvents and different temperatures by using quantum mechanical calculations</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa>علمی پژوهشی کاربردی</content_type_fa>
	<content_type>S</content_type>
	<abstract_fa>رایج ترین و مهم ترین مکانیزم دفاعی باکتریایی نسبت به آنتی بیوتیک های بتالاکتام، تولید آنزیم های بتالاکتاماز است. این داروها از طریق هیدرولیز و شکست حلقه 4-عضوی پیوند بتالاکتام، طی مکانیزمی دو  مرحله ای ، شامل حمله نوکلئوفیلی یون هیدروکسید پل و پروتونه شدن گروه آمین، غیرفعال می شوند. طی این واکنش یون های فلزی نقش مهمی را در فرآیند کاتالیستی ایفا می کنند. البته با وجود مطالعات متعدد، هنوز مکانیزم عملکرد این آنزیم ها نامشخص و بازدارنده مناسب برای آنها گزارش نشده است. نظریه تابعی چگالی (DFT) با استفاده از روش B3LYP و سری های پایه 6-31G، 6-31G* و6-311G**، برای محاسبه جزئیات ساختار و انرژی الکترونی واکنش کاتالیستی بخش فعال آنزیم CcrA از خانواده آنزیم های متالوبتالاکتاماز (M&amp;betaLs)، آنتی بیوتیک بتالاکتام پنی سیلین و کمپلکس های تشکیل شده شامل ES، ETS&lt;sub&gt;1 &lt;/sub&gt;، INT&lt;sub&gt;1&lt;/sub&gt;، INT&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;، ETS&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt; و EP به ترتیب، به کار گرفته شده است. همچنین توابع ترمودینامیکی نظیر، آنتالپی استاندارد (∆Hº&lt;sub&gt; &lt;/sub&gt;)، آنتروپی استاندارد (∆Sº&lt;sub&gt; &lt;/sub&gt;) و انرژی آزاد گیبس استاندارد (∆Gº&lt;sub&gt; &lt;/sub&gt;) واکنش، برایETS&lt;sub&gt;1&lt;/sub&gt; ، ETS&lt;sub&gt;2  &lt;/sub&gt;و برای کل واکنش، در دماهای  C° 25، C° 31، C° 37 و C°40 و فشار 1 اتمسفر، بررسی شد. در همه محاسبات اثر حلال با روش PCM برای حلال های آب، اتانول، محیط پروتئینی، نیترومتان و تترا کلرید کربن در نظر گرفته شده است. در نهایت این واکنش طی یک فرآیند گرمازا و خود به خودی، به پایداری می رسد و مرحله اول مکانیزم واکنش، یعنی حمله نوکلئوفیلی، مرحله تعیین کننده سرعت است</abstract_fa>
	<abstract>The most prevalent and important mechanism of bacterial resistance to &amp;beta-lactam antibiotics, is the production of &amp;beta-lactamase enzymes which inactivate these drugs by the hydrolytic cleavage of the four-membered &amp;beta-lactam ring during two steps which is including the nucleophilic attack of the bridging hydroxide ion on the substrate and eventual protonation of the leaving amine group. During this reaction, metal ions play an important role in the catalytic process. Despite the availability of &amp;beta-lactamase crystallographic structures, their mechanism of action is still unclear and no clinically useful inhibitors of these enzymes have been reported. Density functional theory (DFT) using B3LYP and 6-31G, 6-31G* and 6-311G** basis sets have been employed to calculate the details of electronic structure and electronic energy of catalytic reaction of CcrA enzyme active center from metallo-&amp;beta-lactamase enzymes (M&amp;betaLs), penicillin from &amp;beta-lactam antibiotics, and the formed complexes including ES, ETS&lt;sub&gt;1&lt;/sub&gt;, EI&lt;sub&gt;1&lt;/sub&gt;, EI&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;, ETS&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt; and EP respectively, has been used. Also all the thermodynamic functions including ∆Hº, ∆Sº and ∆Gº to form two transition states, ETS&lt;sub&gt;1&lt;/sub&gt; and ETS&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;, and for the total reaction are evaluated at 25 °C, 31 °C, 37 °C and 40 °C and 1 atmosphere pressure. In all calculations solvent effects have been considered by using PCM method for water, ethanol, protein environment, nitro methane and carbon tetrachloride. Finally this reaction proceeds during an exothermic and spontaneous process, and the first step, the nucleophilic attack of the bridging hydroxide ion on the substrate, is the rate-limiting step</abstract>
	<keyword_fa>آنتی بیوتیک های بتالاکتام , آنزیم های متالوبتالاکتاماز (MβLs) , آنزیمCcrA , پنی سیلین , توابع ترمودینامیکی , محاسبات QM , </keyword_fa>
	<keyword>β-Lactam antibiotics , Metallo-β-lactamase enzymes (MβLs) , CcrA enzyme , Penicillin , Thermodynamic functions , QM calculations , </keyword>
	<start_page>2</start_page>
	<end_page>3</end_page>
	<web_url>http://jsci.khu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3-272&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>bahare</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>noohi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بهاره</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نوحی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>baharenoohi@yahoo.com</email>
	<code>1003194753284600433</code>
	<orcid>1003194753284600433</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه الزهرا</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mansour</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zahedi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>منصور</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>زاهدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>m-zahedi@sbu.ac.ir</email>
	<code>1003194753284600434</code>
	<orcid>1003194753284600434</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه شهید بهشتی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mina</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghiasi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مینا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>غیاثی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ghiasi@alzahra.ac.ir</email>
	<code>1003194753284600435</code>
	<orcid>1003194753284600435</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه الزهرا</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
