یافته های نوین در علوم زیستی

تعیین ژن‌های hub و microRNAهای مربوط به آن‌ها در سرطان پستان از نوع سه گانه منفی

زهره جهان افروز

سرطان پستان یکی از شایع ترین سرطان های دنیا در بین زنان است و سرطان پستان سه گانه منفی یکی از انواع سرطان پستان است. سرطان پستان سه گانه منفی فاقد گیرنده های سطح سلولی شایع شامل گیرنده های استروژن، پروژسترون و فاکتور رشد اپیدرمی است. هدف این مطالعه بررسی ژن های کلیدی تغییر بیان یافته و miRNAهای مربوط به آن ها در سرطان پستان سه گانه منفی و پیشنهاد راه کارهای درمان مولکولی است. ابتدا داده های ریز آرایه mRNA (GSE113865) و miRNA (GSE154255)
برای یافتن ژن ها و miRNAهای تغییر بیان یافته از پایگاه GEO دریافت و با برنامه R بررسی شدند. برهمکنش پروتئین-پروتئین با استفاده از پایگاه STRING و برنامه Cytoscape برای یافتن ژن های hub و رتبه آن ها بررسی شد. مسیرهای سلولی ژن های hub با وبگاه Enrichr و R بررسی شد. در ادامه از پایگاه داده miRDB و miRWalk، که ژن های hub را مورد هدف قرار می دهند یافت شدند و اشتراک آن ها با miRNAهای تغییر بیان یافته بررسی شد. 6 ژن به عنوان ژن های hub کلیدی یافت شدند که به طور معنی دار دچار افزایش بیان شده بودند. ژن های hub کلیدی به طور معنی داری در میان ژن های تنظیمی چرخه سلولی بودند.

همراهی ژن ERCC5 (SNP: rs2296147 T>C) با استعداد ابتلا به سرطان پستان در شمال‌غرب ایران

سارا غفاریان

ژن ERCC5 از اجزای کلیدی مسیر NER است و یک اندونوکلئاز کلیدی را کد می کند. در این پژوهش همراهی چندشکلی rs2296147 T>C ژن ERCC5 با استعداد ابتلا به سرطان پستان در قالب مطالعه مورد-شاهدی و بر روی جامعه آماری متشکل از 100 زن مبتلا به سرطان پستان و 100 فرد سالم با تکنیک Tetra-ARMS PCR مورد بررسی قرار گرفت. تجزیه و تحلیل داده های حاصل با استفاده از برنامه ی آماری آنلاین javastat و نرم افزار SPSS نسخه ی 26 انجام شد. فراوانی ژنوتیپ های CC ، TC و TT در بیماران به ترتیب 46/11، 33/58 و 21/30 درصد و فراوانی آن ها در افراد کنترل به ترتیب 22، 44 و 34 درصد بود. تجزیه های آماری نشان دهنده همراهی معنی دار ژنوتیپ های CC (049/0 =P-value) (007/1- 209/0=, CI 95% 459/0=OR) و CT با سرطان پستان (045/0 =P-value) (139/3- 012/1=, CI 95% 782/1=OR) بود. فراوانی آلل های C و T در بیماران به ترتیب 62/40 و 37/59 درصد و در جمعیت کنترل به ترتیب 44 و 56 درصد بود. نتایج حاصل نشان دهنده عدم همراهی فراوانی هیچ یک از الل های T (499/0 =P-value) و C (499/0 =P-value) با ریسک ابتلا به سرطان پستان بود. از بین ویژگی های بالینی سمت درگیر همراهی معنی داری با توزیع ژنوتیپی این SNP داشت. براساس نتایج حاصل این چندشکلی می تواند باعث افزایش ریسک ابتلا به سرطان پستان در شمال غرب ایران شود.

تاثیر کاربرد بیوچار و محلول‌پاشی با نانوذره روی بر صفات عملکردی و فیزیولوژیکی کدوی تخم‌کاغذی (Cucurbita pepo L.)

لمیا وجودی مهربانی

چکیده. دانه ی کدوی تخم کاغذی به دلیل وجود مقادیر بالای روغناهمیت زیادی در تغذیه و صنایع داروسازی دارد. به منظور بررسی تأثیر کاربرد بیوچار (صفر، 5 و 10 تن در هکتار) و محلول پاشی با نانوذره روی (عدم محلول پاشی، ۲ و ۴ میلی گرم در لیتر) آزمایش فاکتوریل بر مبنای طرح بلوک های کامل تصادفی در مزرعه اجرا شد. تعداد میوه در بوته و محتوای روی برگ در تیمارهای 5 و۱۰ تن در هکتار بیوچار با هر دو سطح محلول پاشی نانوذره روی افزایش یافت. تیمار ۱۰ تن در هکتار بیوچار با محلول پاشی هر دو سطح نانوذره روی موجب افزایش تعداد دانه در میوه، عملکرد میوه، عملکرد بیولوژیک، شاخص برداشت، و عملکرد روغن شد. تیمار ۵ تن در هکتار بیوچار با محلول پاشی ۴ میلی گرم در لیتر نانوذره ی روی و تیمار ۱۰ تن در هکتار بیوچار با محلول پاشی هردو غلظت نانوذره موجب افزایش وزن صددانه، عملکرد بیولوژیک و شاخص کلروفیل گیاه شد. بیشترین محتوای فنل کل در تیمار ۵ و ۱۰ تن در هکتار بیوچار با محلول پاشی ۴ میلی گرم در لیتر نانوذره روی مشاهده شد. محتوای آب نسبی برگ و آنتوسیانین در تیمار۱۰ تن در هکتار بیوچار افزایش یافت. درکل نتایج حاصل از بررسی حاضر نشان داد که استفاده از ۱۰ تن در هکتار بیوچار همراه با محلول پاشی غلظت های ۲ و ۴ میلی گرم در لیتر نانوذره روی موجب افزایش صفات عملکردی و فیزیولوژیکی گیاه شد.

مطالعه بیوسیستماتیکی گونه ی دارواش کوتوله (Santalaceae) oxcyderi Arceuhobium در منطقه چهارباغ (استان گلستان)

الهام امینی

گونه ی Arceuthobium oxycedri (دارواش کوتوله)، اختصاصا روی گونه های سرو کوهی رشد کرده و آن ها را آلوده می کند. گیاه نیمه انگلی مذکور در ایران در سه رویشگاه ارس رضا آباد استان سمنان، منطقه چهار باغ گرگان و در استان زنجان مشاهده شده است. در این تحقیق شاخص های آناتومی و صفات ریزریخت شناسی گونه با هدف کمک به شناسایی این گونه نیمه انگلی گیاهی در استان گلستان مورد ارزیابی قرار گرفت. برای تخمین آلودگی درختان ارس توسط گیاه نیمه انگلی دارواش کوتوله نمونه برداری در منطقه چهارباغ گرگان در سطح 600 هکتار و با استفاده از 60 قطعه نمونه و به ابعاد 20×20 متر مربع به صورت تصادفی_ سیستماتیک انجام شد. برشی عرضی ساقه نشان داد که در هر 3 ارتفاع دارای سطح مقطع نیم دایره ای، دارای کلروفیل و از نظر ضخامت پوست و اندازه مغز باهم تفاوتی ندارند. مطالعات دانه گرده نشان داد که تمامی دانه های گرده به صورت منفرد، دارای سه تا پنج شیار عمیق و نامتقارن، شیارها از نظر اندازه کوچک و بزرگ هستند (Tricolpate). از لحاظ شکل مخروطی کروی (Oblatespheroidal) با تزئینات اگزین خاردار (Echinate) می باشند. در مجموع با توجه به اینکه این تحقیق برای اولین بار بر روی گونه دارواش کوتوله انجام می شود یافته های آن برای شناسایی گونه های مشابه که در سایر رویشگاههای ارس ایران گزارش شده ارزش سیستماتیکی دارد.

مطالعه برهمکنش سه ایزوفرم UDP-گلوکورونوزیل ترانسفراز با مهارکننده های تیروزین کیناز موثر در مقاومت دارویی

ریحانه چمنی

غیرفعال شدن داروها توسط آنزیم ها به ویژه UDP-گلوکورونوزیل ترانسفرازها (UGT) یکی از دلایل مقاومت دارویی است. هدف از مطالعه حاضر بررسی برهمکنش آنزیم های UGT1A3, UGT1A1 و UGT2B7 با مهارکننده های تیروزین کیناز بود. ساختار آنزیم ها به روش مدلسازی همسانی ساخته شد و ساختار 300 مهارکننده تیروزین کیناز از پایگاه Pubchem دریافت شد. شبیه سازی داکینگ مولکولی به وسیله نرم افزار PyRx 0.8 انجام شد و کمپلکس ها بر اساس منفی ترین انرژی اتصال و RMSD صفر مرتب و اسیدآمینه های درگیر در اتصال بررسی شدند. در مجموع چهل و پنج دارو به عنوان سوبستراهای احتمالی این سه آنزیم معرفی شدند. نتایج نشان دادند که محل اتصال این داروها به اسیدآمینه های جایگاه فعال آنزیم ها بوده و انرژی اتصال لیگاندها به UGT1A1 منفی تر از دو آنزیم دیگر بود. می توان پیشنهاد کرد که گلوکورونیداسیون احتمالی این مهارکننده ها توسط آنزیم های UGT می تواند منجر به دو اتفاق مهم شود: اول حذف سریع آنها از گردش خون و ایجاد مقاومت دارویی و دوم جلوگیری از گلوکورنیداسیون بیلی روبین و افزایش سطح بیلی روبین سرم. بنابراین بررسی آزمایشگاهی ارتباط بین این مهارکننده ها و آنزیم های UGT می تواند ضروری باشد.

سنتز سبز نانوذرات نقره با عصاره گیاه ماهور و بررسی اثر آن بر بیان ژن BfmR در ایزوله های بالینی اسینتوباکتر بومانی

سمانه دولت آبادی

چکیده: اسینتوباکتربومانی یک پاتوژن فرصت طلب مقاوم به چند دارو است که باعث عفونت های تنفسی و مجاری ادراری می شود. بنابراین، توسعه یک داروی جایگزین علیه اسینتوباکتر از اهمیت بالایی برخوردار است. هدف از این مطالعه بررسی فعالیت ضد باکتریایی نانو ذرات نقره که به روش سبز سنتز شده اند بر روی رشد اسینتوباکتر بومانی و بیان ژن BfmR می باشد. در این مطالعه نانوذرات نقره درترکیب با عصاره گل ماهور (Verbascum thapsus) سنتز شد و مشخصات آن توسط تفرق اشعه ایکس، اسپکتروفوتومتری، میکروسکوپ الکترونی TEM و آنالیز پتانسیل زتا مشخص گردید. فعالیت ضدباکتریایی نانوذرات با استفاده از آنالیز MICانجام گرفت. همچنین اثر نانوذرات روی بیان ژن BfmR با استفاده از real-time PCR بررسی شد. نتایج نشان داد نانوذرات سبز آماده شده، اندازه ی حدوداً 30 نانومتر داشتند. با آنالیز MIC مشخص گردید که نانوذرات در برابر اسینتوباکتر بومانی از خود فعالیت ضد باکتریایی نشان می دهند. نتایج بیان ژن نیز نشان دهنده ی مکانیسم تنظیم کاهشی بیان ژن BfmR توسط نانو ذرات سنتز شده با گیاه ماهور می باشد که منجر به کاهش تشکیل بیوفیلم به صورت معنی دار می گردد. نانوذرات برپایه فلز، به ویژه نانوذرات نقره، به دلیل خواص فیزیکی و شیمیایی منحصر به فرد و فعالیت ضدباکتریایی گسترده ای که دارند، محبوبیت زیادی را برای گزینه های ضد باکتری به دست آورده اند. نانوذرات بدست آمده از عصاره گل ماهور می توانند بیان ژن BfmR را کاهش داده و بدین ترتیب تشکیل بیوفیلم را مهار کرده و موجب اثرات ضدباکتریایی شوند.

تأثیر آهن و کیتوزان بر شاخص‌های رشدی، قند محلول و یون‌های سدیم، پتاسیم، آهن و کلسیم در گیاه کاملینا تحت تنش شوری

اعظم سلیمی

گیاه کاملینا عضو مهم خانواده Cruciferae، به عنوان یک گیاه روغنی استفاده می شود. کیتوزان یک بیوپلیمر طبیعی که به عنوان یک محرک زیستی و ترکیب غیر سمی و سازگار با محیط زیست می باشد که به طور گسترده ای در پاسخ به تنش های زیستی و غیر زیستی مؤثر است. آهن یک ریزمغذی ضروری برای همه موجودات زنده است زیرا نقش مهمی در فرآیندهای تنفس و فتوسنتز دارد. در این تحقیق تأثیر کیتوزان و آهن همراه با تیمار شوری 0، 8، 12، دسی زیمنس بر متر و کیتوزان با غلظت های 0، 2/0، 4/0، گرم بر لیتر و آهن نیز با غلظت های 0، 3، 6، گرم بر لیتر و به صورت فاکتوریل بر پایه طرح بلوک های کامل تصادفی با سه تکرار انجام شد. به دلیل به هم خوردن تعادل یونی میزان سدیم افزایش داشته، از طرفی رشد ریشه افزایش داشته تا بتواند آب مورد نیاز گیاه را تأمین کند. با توجه به اثرات مخرب تنش، افزایش سدیم بر سایر پارامترها نیز تأثیر داشته و باعث کاهش آهن، کلسیم، طول ساقه و وزن خشک اندام هوایی شده است. در بررسی اثر متقابل شوری، کیتوزان و آهن مشاهده شده که طول ساقه، سطح برگ، بیومس، محتوای نسبی آب، سدیم، پتاسیم و کلسیم و کربوهیدرات افزایش یافته اند و وزن خشک ریشه کاهش پیدا کرده است. تیمارهای نامبرده با تأثیر بر محتوای نسبی آب، تنظیم یون ها و محلول های سازگاری مانند قند برگ توانسته شرایط گیاه را مانند شرایط بدون تنش حفظ کند و اثرات ناشی از تنش شوری را کاهش داده و به رشد گیاه کمک کند.