Nova Biologica Reperta
یافته های نوین در علوم زیستی
NBR
Basic Sciences
http://nbr.khu.ac.ir
1
admin
2423-6330
2476-7115
10.52547/nbr
en
jalali
1397
6
1
gregorian
2018
9
1
5
2
online
1
fulltext
fa
بررسی تاریخ تکاملی زیرگونۀ کمرکولی جنگلی در کوه های زاگرس، ایران
Evolutionary history of subspecies of Eurasian nuthatches (Sitta europaea persica) from Zagros Mountains, Iran
ژنتیک
Genetics
مقاله پژوهشی
Original Article
<p dir="RTL" style="margin: 0cm 0cm 0pt; text-align: justify; line-height: normal;"><font color="#000000"><b><span b="" lang="FA" mso-ansi-font-size:="" mso-bidi-font-size:="" style="font-family: "><font size="3">چکیده. </font></span></b><span b="" font-size:="" lang="FA" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: ">کمرکولی جنگلی در ناحیۀ اوراسیا با حدود 18 زیرگونه از گسترش وسیعی در جنگل­ های کهنسال خزان­کنندۀ پهن ­برگ برخوردار است. جمعیت مقیم این پرنده در جنگل­ های پهنبرگ بلوط در رشته کوه زاگرس به عنوان </span><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: "><font face="Times New Roman">S.e.persica</font></span><span b="" font-size:="" lang="FA" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: "> معرفی شده است. هدف از این مطالعه بررسی ساختار ژنتیکی و روابط تکاملی زیرگونۀ کمرکولی جنگلی رشته کوه زاگرس در مقایسه با کلادهای اروپایی (</span><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: "><font face="Times New Roman">European</font></span><span b="" font-size:="" lang="FA" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: ">)، آسیایی (</span><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: "><font face="Times New Roman">Asian</font></span><span b="" font-size:="" lang="FA" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: ">) و قفقازی (</span><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: "><font face="Times New Roman">Caucasian</font></span><span b="" font-size:="" lang="FA" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: ">) است. برای این منظور تعداد 10 فرد از دو ناحیه زاگرس شمالی در استان کرمانشاه و زاگرس جنوبی در استان کهگیلویه و بویراحمد با مجوز از سازمان حفاظت محیط زیست زنده­گیری و نمونه­ های خون آنها برداشت شد. مطالعات ژنتیکی با استفاده از 136 توالی کامل ژن </span><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: "><font face="Times New Roman">ND2</font></span><span b="" font-size:="" lang="FA" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: "> (1041جفت باز) مستخرج از بانک ژن و 10 توالی از رشته کوه زاگرس تحت بررسی قرار گرفت. تحلیل­های تبارشناسی با استفاده از مدل </span><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: "><font face="Times New Roman">TRN +G</font></span><span b="" font-size:="" lang="FA" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: "> و رسم درخت بیزین و حداکثر درست نمایی انجام گرفت. همچنین روابط بین هاپلوتایپها با استفاده الگوریتمهای اتصال میانه و پارسیمونی تحت بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که از 10 نمونۀ توالی یابی شده، چهار هاپلوتایپ منحصر به فرد حاصل شد. همچنین تحلیلهای تبارشناسی حاکی از آن بود که جمعیتهای زاگرس از تبار قفقازی تفکیکپذیر است. همچنین از 10 نمونۀ توالی یابی شده، چهار هاپلوتایپ منحصر به فرد حاصل شد. نتایج آمارۀ </span><font face="Times New Roman"><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: ">F</span><sub><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: ">ST</span></sub></font><span b="" font-size:="" lang="FA" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: "> حاصل از تحلیل واریانس مولکولی </span><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: "><font face="Times New Roman">(AMOVA)</font></span><span b="" font-size:="" lang="FA" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: "> تغییرات معنیدار ساختار ژنتیکی را در بین جمعیتهای مختلف کمرکولی جنگلی را نشان داد. آمارۀ </span><font face="Times New Roman"><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: ">F</span><sub><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: ">CT</span></sub></font><span b="" font-size:="" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: "> <span lang="FA">نیز حاکی از بروز تغییرات ژنتیکی قابل توجه در بین جمعیتهای مختلف تبارهای آسیا، اروپا، قفقاز و زاگرس بود. در نهایت جمعیتهای مختلف کمرکولی جنگلی در اوراسیا را میتوان به سه گونۀ تکامل نژادی تقسیم نمود و زیرگونههای </span></span><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: "><font face="Times New Roman">S.e.persica</font></span><span b="" font-size:="" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: "> <span lang="FA">و </span></span><span b="" dir="LTR" style="font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: "><font face="Times New Roman">S.e.caucasian</font></span><span b="" font-size:="" lang="FA" mso-ansi-font-size:="" style="font-family: "> را بعنوان دو گونۀ تکامل نژادی مشترک در نظر گرفت. </span></font></p>
<p style="margin: 0cm 0cm 0pt; text-align: justify; line-height: normal; unicode-bidi: embed; direction: ltr;"><font color="#000000"><font face="Times New Roman"><b><span new="" style="font-size: 10pt; mso-bidi-font-family: " times="">Abstract. </span></b><span new="" style="font-size: 10pt; mso-bidi-font-family: " times="">Eurasian Nuthatch (<i>Sitta europaea</i>), with 18 subspecies, has a wide distribution in deciduous forests of Eurasia. The subspecies <i>S.e.persica </i>is a resident bird in the Zagros Mountains, from north-west to south-west of Iran. The aim of this study was to evaluate the taxonomic and phylogenetic relationships of this subspecies to European, Asian, as well as Caucasian clades. For this purpose, 10 individuals of two populations from Zagros forests in Kermansha and Kohgiluyeh and Boyer-Ahmad provinces were captured and blood samples were collected. Furthermore, we used ND2 sequence data (1041 bp) for 136 sequnces from GenBank. were used from Then genetic variations and Genealogical analysis was calculated using complete ND2 gene sequence (1041bp) and TRN+G model, Bayesian trees and maximum likelihood, respectively. Also, median joining algorithm showed the relationships among haplotypes. We found four new haplotypes for the Zagros populations. Our phylogenetic analysis revealed that the genetic distance between Zagros population and Caucasian clade was significantly small, demonstrating Zagros populations are part of the Caucasian clade. <i>F</i><sub>ST </sub>statistical values, resulted from Analysis of Molecular Variance (AMOVA), represented significant variations in genetic structure among Eurasian Nuthatch populations. Moreover, <i>F</i><sub>CT </sub>revealed significant variation among European, Asian, and Caucasian clades. Overall our result suggests that Eurasian Nuthatch populations in Eurasia comprise three phylogenetic species, and likely biological species. Hoewever, the previous nomenclatured subspecies, <i>S.e.caucasian </i>and<i> S.e.persica</i>, can be considered as a common phylogenetic species. </span></font></font></p>
اوراسیا, روابط فیلوژنی, گونۀ تکامل نژادی, میتوکندری, نشانگر ND2ND2
Phylogenetic relationship, phylogenetic species, mtDNA marker, ND2
155
167
http://nbr.khu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-309-4&slc_lang=fa&sid=1
masoud
nazarizadeh
مسعود
نظری زاده
nazarizadeh1990
10031947532846005264
10031947532846005264
No
university of tehran
دانشگاه تهران
mohammad
kaboli
محمد
کابلی
mkboli@ut.ac.ir
10031947532846005265
10031947532846005265
Yes
university of tehran
دانشگاه تهران
hamidreza
rezai
حمیدرضا
رضایی
rezaei@gau.ac.ir
10031947532846005266
10031947532846005266
No
Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
دانشگاه منابع طبیعی و کشاورزی گرگان
jalil
imani
جلیل
ایمانی
jalil.imani@ut.ac.ir
10031947532846005267
10031947532846005267
No
Islamic Azad University
دانشگاه آزاد اسلامی
alireza
mohammadi
علیرضا
محمدی
armohammadi1989@gmail.com
10031947532846005268
10031947532846005268
No
university of tehran
دانشگاه تهران
saeid
khaki
سعید
خاکی
saeidkhaki30@ut.ac.ir
10031947532846005269
10031947532846005269
No
university of tehran
دانشگاه تهران