زهرا توکلی، بهناز صفار، کریم مهنام، روح اله همتی،
دوره 11، شماره 3 - ( 9-1403 )
چکیده
یکی از بحران های آینده نزدیک بشریت همه گیری بیماری های عفونی بعلت مقاومت آنتی بیوتیکی باکتری ها است. پپتیدهای خانواده هیستاتین دارای خصوصیت ضدمیکروبی علیه سویههای مقاوم به دارو و التیام زخم می باشند. در این پژوهش، ابتدا پپتید هیستاتین3 توسط برنامه گرومکس 5 به مدت 50 نانوثانیه در حضور آب و یون ها و همچنین در حضور میسل SDS به عنوان مدل غشا باکتری شبیهسازی پویایی مولکولی شد. سپس به منظور افزایش خاصیت ضد باکتری، هشت جهش مختلف در این پپتید طراحی و ساختارآنها تهیه شد و هرکدام با همان شرایط قبل در حضور آب و در حضور آب و میسل SDS بطور جداگانه شبیهسازی پویایی مولکولی شدند و انرژی آزاد اتصال پپتیدها با میسل SDS با روش MM/PBSA محاسبه شد. در نهایت 950 نانوثانیه شبیه سازی پویایی مولکولی در شرایط ذکر شده نشان داد که جهش ترکیبی D1A-G9W دارای منفیترین انرژی آزاد اتصال به میسل SDS است. نتایج بررسی های آزمونهای میکروبی MIC این جهش برروی باکتریهای گرم مثبت و گرم منفی، نشان از افزایش خاصیت ضدمیکروبی آن برروی باکتری های گرم مثبت داشت.